Первым ректором ЧГУ был назначен доктор технических наук, профессор Семен Федорович Сайкин, уроженец Чувашской Республики, проработавший много лет в одном из старейших вузов страны – Казанском государственном университете, в котором сложились известные научные школы. Проректором по науке нового вуза стал крупный ученый профессор С.А. Абруков, проректором по учебной работе – А.К. Аракелян. Вместе с ними в университет пришли молодые талантливые преподаватели и исследователи из многих учебных заведений страны.

В июле 1981 г. вторым ректором Чувашского государственного университета назначается профессор П. А. Сидоров. Находясь на этом посту в течение девяти лет, он проводит большую работу по дальнейшему формированию университета, своевременно решает узловые проблемы, прежде всего проблему развития материально-технической базы. При нем строятся новый учебный корпус.

В декабре 1990 г. начал работу выбранный на конкурсной основе новый ректор университета доктор экономических наук, профессор Лев Пантелеймонович Кураков.

12 января 2010 г. приказом Федерального агентства по образованию в должности ректора Чувашского государственного университета имени И.Н. Ульянова утвержден профессор Всеволод Георгиевич Агаков.

23 декабря 2013 г. Министр образования и науки Российской Федерации Д.В. Ливанов подписал приказ №12-07-03/210 об утверждении Александрова Андрея Юрьевича в должности ректора федерального государственного бюджетного образовательного учреждения высшего профессионального образования «Чувашский государственный университет имени И.Н. Ульянова» с 3 января 2014 г. по 2 января 2019 г.

12 декабря 2018 г. на конференции научно-педагогических работников, представителей других категорий работников и обучающихся Андрей Юрьевич Александров избран на новый срок  ректором Чувашского государственного университета имени И.Н. Ульянова и приказом Министра  науки и высшего образования Российской Федерации  утвержден в этой должности сроком на 6 лет.